Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COPZ1P61923 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COPZ1P61923 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPZ1P61923 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms