Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM3BP58499 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms