Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCBP4P57723 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCBP4P57723 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCBP4P57723 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms