Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIK1P57059 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIK1P57059 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIK1P57059 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIK1P57059 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SIK1P57059 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SIK1P57059 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SIK1P57059 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SIK1P57059 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SIK1P57059 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SIK1P57059 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SIK1P57059 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SIK1P57059 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SIK1P57059 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SIK1P57059 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SIK1P57059 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SIK1P57059 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SIK1P57059 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SIK1P57059 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SIK1P57059 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SIK1P57059 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SIK1P57059 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SIK1P57059 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SIK1P57059 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SIK1P57059 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SIK1P57059 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SIK1P57059 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SIK1P57059 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SIK1P57059 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SIK1P57059 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SIK1P57059 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SIK1P57059 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SIK1P57059 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SIK1P57059 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SIK1P57059 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SIK1P57059 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SIK1P57059 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SIK1P57059 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SIK1P57059 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SIK1P57059 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SIK1P57059 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
SIK1P57059 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SIK1P57059 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SIK1P57059 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
SIK1P57059 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SIK1P57059 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SIK1P57059 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
SIK1P57059 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SIK1P57059 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SIK1P57059 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SIK1P57059 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SIK1P57059 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SIK1P57059 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIK1P57059 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIK1P57059 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SIK1P57059 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SIK1P57059 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SIK1P57059 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIK1P57059 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIK1P57059 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIK1P57059 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SIK1P57059 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SIK1P57059 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SIK1P57059 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SIK1P57059 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SIK1P57059 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SIK1P57059 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SIK1P57059 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SIK1P57059 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
SIK1P57059 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIK1P57059 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SIK1P57059 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SIK1P57059 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIK1P57059 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIK1P57059 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIK1P57059 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SIK1P57059 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIK1P57059 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SIK1P57059 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SIK1P57059 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SIK1P57059 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SIK1P57059 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SIK1P57059 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SIK1P57059 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SIK1P57059 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SIK1P57059 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIK1P57059 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIK1P57059 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SIK1P57059 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIK1P57059 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIK1P57059 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIK1P57059 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIK1P57059 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIK1P57059 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIK1P57059 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIK1P57059 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIK1P57059 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIK1P57059 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIK1P57059 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIK1P57059 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms