Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNU13P55769 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SNU13P55769 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNU13P55769 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNU13P55769 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNU13P55769 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SNU13P55769 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNU13P55769 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNU13P55769 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNU13P55769 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNU13P55769 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNU13P55769 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNU13P55769 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNU13P55769 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SNU13P55769 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNU13P55769 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNU13P55769 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNU13P55769 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNU13P55769 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SNU13P55769 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNU13P55769 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNU13P55769 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNU13P55769 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNU13P55769 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNU13P55769 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNU13P55769 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNU13P55769 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SNU13P55769 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNU13P55769 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNU13P55769 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNU13P55769 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNU13P55769 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNU13P55769 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNU13P55769 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SNU13P55769 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNU13P55769 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNU13P55769 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNU13P55769 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNU13P55769 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNU13P55769 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNU13P55769 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNU13P55769 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SNU13P55769 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNU13P55769 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNU13P55769 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNU13P55769 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNU13P55769 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNU13P55769 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNU13P55769 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNU13P55769 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SNU13P55769 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SNU13P55769 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNU13P55769 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNU13P55769 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNU13P55769 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNU13P55769 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNU13P55769 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNU13P55769 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNU13P55769 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNU13P55769 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNU13P55769 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SNU13P55769 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNU13P55769 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNU13P55769 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNU13P55769 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNU13P55769 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNU13P55769 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNU13P55769 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNU13P55769 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNU13P55769 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNU13P55769 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNU13P55769 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNU13P55769 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNU13P55769 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNU13P55769 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNU13P55769 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNU13P55769 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNU13P55769 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNU13P55769 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNU13P55769 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNU13P55769 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNU13P55769 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNU13P55769 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNU13P55769 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNU13P55769 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNU13P55769 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNU13P55769 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNU13P55769 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNU13P55769 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNU13P55769 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNU13P55769 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNU13P55769 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNU13P55769 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNU13P55769 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNU13P55769 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNU13P55769 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNU13P55769 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNU13P55769 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNU13P55769 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNU13P55769 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms