Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEK4P51957 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEK4P51957 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEK4P51957 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEK4P51957 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEK4P51957 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEK4P51957 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEK4P51957 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEK4P51957 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEK4P51957 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEK4P51957 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEK4P51957 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEK4P51957 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEK4P51957 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEK4P51957 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEK4P51957 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEK4P51957 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEK4P51957 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NEK4P51957 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEK4P51957 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEK4P51957 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEK4P51957 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEK4P51957 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEK4P51957 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEK4P51957 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEK4P51957 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEK4P51957 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEK4P51957 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEK4P51957 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEK4P51957 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEK4P51957 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEK4P51957 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NEK4P51957 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEK4P51957 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEK4P51957 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEK4P51957 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEK4P51957 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEK4P51957 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEK4P51957 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NEK4P51957 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEK4P51957 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEK4P51957 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NEK4P51957 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK4P51957 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK4P51957 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK4P51957 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK4P51957 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK4P51957 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK4P51957 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK4P51957 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK4P51957 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEK4P51957 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEK4P51957 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEK4P51957 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEK4P51957 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEK4P51957 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEK4P51957 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEK4P51957 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEK4P51957 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEK4P51957 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEK4P51957 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEK4P51957 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEK4P51957 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEK4P51957 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NEK4P51957 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEK4P51957 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEK4P51957 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEK4P51957 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NEK4P51957 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NEK4P51957 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEK4P51957 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NEK4P51957 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEK4P51957 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NEK4P51957 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEK4P51957 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEK4P51957 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEK4P51957 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEK4P51957 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEK4P51957 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NEK4P51957 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEK4P51957 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEK4P51957 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEK4P51957 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEK4P51957 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEK4P51957 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEK4P51957 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEK4P51957 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEK4P51957 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEK4P51957 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEK4P51957 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEK4P51957 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEK4P51957 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK4P51957 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK4P51957 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK4P51957 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEK4P51957 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEK4P51957 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEK4P51957 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEK4P51957 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEK4P51957 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms