Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PSMD8P48556 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PSMD8P48556 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PSMD8P48556 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms