Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL28P46779 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL28P46779 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL28P46779 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL28P46779 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL28P46779 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL28P46779 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL28P46779 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL28P46779 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL28P46779 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL28P46779 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL28P46779 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL28P46779 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL28P46779 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL28P46779 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL28P46779 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL28P46779 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL28P46779 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL28P46779 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL28P46779 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL28P46779 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL28P46779 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL28P46779 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL28P46779 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL28P46779 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL28P46779 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL28P46779 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL28P46779 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL28P46779 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL28P46779 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL28P46779 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL28P46779 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL28P46779 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL28P46779 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL28P46779 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL28P46779 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL28P46779 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL28P46779 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL28P46779 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL28P46779 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL28P46779 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL28P46779 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL28P46779 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL28P46779 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL28P46779 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL28P46779 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL28P46779 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL28P46779 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPL28P46779 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL28P46779 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL28P46779 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL28P46779 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL28P46779 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL28P46779 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPL28P46779 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL28P46779 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL28P46779 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL28P46779 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL28P46779 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL28P46779 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL28P46779 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL28P46779 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL28P46779 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL28P46779 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL28P46779 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL28P46779 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL28P46779 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL28P46779 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL28P46779 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL28P46779 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL28P46779 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL28P46779 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL28P46779 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL28P46779 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL28P46779 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL28P46779 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL28P46779 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms