Protein–RNA interactions for Protein: P41743

PRKCI, Protein kinase C iota type, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCIP41743 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKCIP41743 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRKCIP41743 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRKCIP41743 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms