Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARGP37231 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARGP37231 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARGP37231 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARGP37231 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARGP37231 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPARGP37231 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARGP37231 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARGP37231 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARGP37231 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARGP37231 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARGP37231 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARGP37231 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPARGP37231 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPARGP37231 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPARGP37231 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPARGP37231 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPARGP37231 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPARGP37231 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPARGP37231 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPARGP37231 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPARGP37231 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARGP37231 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARGP37231 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARGP37231 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARGP37231 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARGP37231 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPARGP37231 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGP37231 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGP37231 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGP37231 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGP37231 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGP37231 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGP37231 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPARGP37231 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGP37231 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGP37231 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGP37231 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGP37231 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGP37231 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGP37231 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGP37231 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPARGP37231 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGP37231 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGP37231 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGP37231 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGP37231 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGP37231 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGP37231 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPARGP37231 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGP37231 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGP37231 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGP37231 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGP37231 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGP37231 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGP37231 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGP37231 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGP37231 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGP37231 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGP37231 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPARGP37231 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGP37231 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGP37231 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGP37231 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGP37231 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGP37231 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGP37231 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGP37231 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGP37231 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGP37231 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPARGP37231 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGP37231 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGP37231 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGP37231 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGP37231 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGP37231 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGP37231 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGP37231 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGP37231 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGP37231 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGP37231 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGP37231 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGP37231 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGP37231 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGP37231 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGP37231 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPARGP37231 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARGP37231 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARGP37231 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARGP37231 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARGP37231 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARGP37231 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARGP37231 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPARGP37231 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGP37231 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGP37231 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGP37231 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGP37231 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGP37231 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPARGP37231 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms