Protein–RNA interactions for Protein: P35790

CHKA, Choline kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKAP35790 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKAP35790 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKAP35790 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKAP35790 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKAP35790 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKAP35790 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKAP35790 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKAP35790 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKAP35790 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKAP35790 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKAP35790 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKAP35790 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHKAP35790 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHKAP35790 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHKAP35790 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHKAP35790 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHKAP35790 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHKAP35790 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHKAP35790 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHKAP35790 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHKAP35790 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHKAP35790 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHKAP35790 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHKAP35790 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHKAP35790 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHKAP35790 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHKAP35790 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHKAP35790 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CHKAP35790 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHKAP35790 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHKAP35790 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHKAP35790 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHKAP35790 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CHKAP35790 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHKAP35790 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHKAP35790 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHKAP35790 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHKAP35790 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHKAP35790 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHKAP35790 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHKAP35790 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHKAP35790 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHKAP35790 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHKAP35790 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHKAP35790 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHKAP35790 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHKAP35790 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHKAP35790 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHKAP35790 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHKAP35790 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHKAP35790 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHKAP35790 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHKAP35790 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHKAP35790 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHKAP35790 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHKAP35790 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHKAP35790 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHKAP35790 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHKAP35790 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHKAP35790 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHKAP35790 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHKAP35790 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHKAP35790 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHKAP35790 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHKAP35790 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHKAP35790 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHKAP35790 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHKAP35790 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHKAP35790 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHKAP35790 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHKAP35790 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHKAP35790 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHKAP35790 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHKAP35790 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHKAP35790 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHKAP35790 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHKAP35790 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHKAP35790 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHKAP35790 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHKAP35790 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHKAP35790 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHKAP35790 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHKAP35790 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHKAP35790 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHKAP35790 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHKAP35790 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHKAP35790 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHKAP35790 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHKAP35790 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHKAP35790 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHKAP35790 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHKAP35790 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHKAP35790 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHKAP35790 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHKAP35790 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHKAP35790 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHKAP35790 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHKAP35790 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHKAP35790 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHKAP35790 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms