Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ABCC1P33527 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
ABCC1P33527 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
ABCC1P33527 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ABCC1P33527 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ABCC1P33527 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ABCC1P33527 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ABCC1P33527 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ABCC1P33527 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ABCC1P33527 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ABCC1P33527 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ABCC1P33527 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
ABCC1P33527 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ABCC1P33527 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ABCC1P33527 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
ABCC1P33527 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ABCC1P33527 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms