Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX1P32242 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX1P32242 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX1P32242 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX1P32242 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX1P32242 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX1P32242 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX1P32242 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX1P32242 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX1P32242 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OTX1P32242 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTX1P32242 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTX1P32242 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTX1P32242 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTX1P32242 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTX1P32242 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTX1P32242 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OTX1P32242 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
OTX1P32242 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
OTX1P32242 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTX1P32242 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTX1P32242 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTX1P32242 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OTX1P32242 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
OTX1P32242 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX1P32242 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX1P32242 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX1P32242 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX1P32242 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX1P32242 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX1P32242 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX1P32242 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OTX1P32242 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX1P32242 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX1P32242 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX1P32242 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX1P32242 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX1P32242 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX1P32242 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX1P32242 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX1P32242 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX1P32242 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX1P32242 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTX1P32242 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
OTX1P32242 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTX1P32242 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTX1P32242 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTX1P32242 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTX1P32242 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX1P32242 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX1P32242 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX1P32242 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX1P32242 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX1P32242 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX1P32242 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX1P32242 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX1P32242 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX1P32242 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX1P32242 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX1P32242 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTX1P32242 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTX1P32242 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
OTX1P32242 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTX1P32242 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTX1P32242 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX1P32242 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX1P32242 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX1P32242 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX1P32242 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX1P32242 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX1P32242 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX1P32242 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTX1P32242 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTX1P32242 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTX1P32242 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTX1P32242 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTX1P32242 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTX1P32242 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTX1P32242 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX1P32242 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX1P32242 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX1P32242 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX1P32242 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX1P32242 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX1P32242 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX1P32242 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX1P32242 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX1P32242 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX1P32242 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX1P32242 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX1P32242 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTX1P32242 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTX1P32242 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
OTX1P32242 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
OTX1P32242 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTX1P32242 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
OTX1P32242 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTX1P32242 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTX1P32242 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTX1P32242 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms