Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCND3P30281 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCND3P30281 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCND3P30281 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCND3P30281 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCND3P30281 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCND3P30281 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCND3P30281 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCND3P30281 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCND3P30281 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCND3P30281 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCND3P30281 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCND3P30281 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCND3P30281 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCND3P30281 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCND3P30281 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND3P30281 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND3P30281 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND3P30281 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND3P30281 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND3P30281 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND3P30281 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND3P30281 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND3P30281 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND3P30281 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND3P30281 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCND3P30281 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCND3P30281 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCND3P30281 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCND3P30281 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCND3P30281 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCND3P30281 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCND3P30281 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCND3P30281 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCND3P30281 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCND3P30281 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCND3P30281 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCND3P30281 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCND3P30281 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCND3P30281 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCND3P30281 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCND3P30281 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCND3P30281 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCND3P30281 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCND3P30281 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCND3P30281 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCND3P30281 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCND3P30281 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCND3P30281 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCND3P30281 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCND3P30281 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCND3P30281 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCND3P30281 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCND3P30281 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCND3P30281 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCND3P30281 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCND3P30281 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCND3P30281 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCND3P30281 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCND3P30281 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCND3P30281 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCND3P30281 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCND3P30281 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCND3P30281 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCND3P30281 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCND3P30281 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCND3P30281 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CCND3P30281 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCND3P30281 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCND3P30281 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCND3P30281 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCND3P30281 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCND3P30281 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCND3P30281 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCND3P30281 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCND3P30281 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCND3P30281 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCND3P30281 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCND3P30281 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCND3P30281 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCND3P30281 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCND3P30281 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CCND3P30281 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCND3P30281 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCND3P30281 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCND3P30281 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCND3P30281 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCND3P30281 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCND3P30281 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCND3P30281 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCND3P30281 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCND3P30281 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCND3P30281 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCND3P30281 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCND3P30281 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCND3P30281 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCND3P30281 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCND3P30281 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCND3P30281 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCND3P30281 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms