Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXD10P28358 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HOXD10P28358 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms