Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
XPAP23025 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
XPAP23025 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPAP23025 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPAP23025 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPAP23025 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPAP23025 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XPAP23025 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPAP23025 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPAP23025 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPAP23025 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPAP23025 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPAP23025 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPAP23025 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPAP23025 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPAP23025 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XPAP23025 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
XPAP23025 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPAP23025 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPAP23025 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
XPAP23025 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPAP23025 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPAP23025 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPAP23025 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPAP23025 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPAP23025 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XPAP23025 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPAP23025 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPAP23025 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPAP23025 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPAP23025 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
XPAP23025 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPAP23025 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPAP23025 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XPAP23025 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPAP23025 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
XPAP23025 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPAP23025 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XPAP23025 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPAP23025 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPAP23025 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPAP23025 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPAP23025 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPAP23025 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPAP23025 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPAP23025 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XPAP23025 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPAP23025 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPAP23025 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
XPAP23025 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPAP23025 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPAP23025 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPAP23025 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPAP23025 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPAP23025 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPAP23025 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPAP23025 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPAP23025 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPAP23025 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPAP23025 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPAP23025 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPAP23025 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
XPAP23025 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
XPAP23025 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
XPAP23025 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPAP23025 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPAP23025 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPAP23025 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPAP23025 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPAP23025 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPAP23025 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPAP23025 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPAP23025 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPAP23025 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPAP23025 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPAP23025 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPAP23025 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPAP23025 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPAP23025 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPAP23025 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPAP23025 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPAP23025 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPAP23025 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPAP23025 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
XPAP23025 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPAP23025 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPAP23025 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPAP23025 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPAP23025 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPAP23025 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPAP23025 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPAP23025 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPAP23025 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPAP23025 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
XPAP23025 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPAP23025 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
XPAP23025 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPAP23025 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPAP23025 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
XPAP23025 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.7 ms