Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFNA1P20827 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFNA1P20827 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFNA1P20827 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms