Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN1P18031 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN1P18031 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPN1P18031 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN1P18031 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms