Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRM1P11229 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRM1P11229 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHRM1P11229 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.9 ms