Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC2P0DI81 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2P0DI81 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2P0DI81 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.9 ms