Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMBSP08397 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMBSP08397 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMBSP08397 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMBSP08397 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMBSP08397 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMBSP08397 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMBSP08397 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMBSP08397 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMBSP08397 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HMBSP08397 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HMBSP08397 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HMBSP08397 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HMBSP08397 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HMBSP08397 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMBSP08397 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMBSP08397 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMBSP08397 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMBSP08397 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMBSP08397 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMBSP08397 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMBSP08397 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMBSP08397 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMBSP08397 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMBSP08397 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMBSP08397 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMBSP08397 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMBSP08397 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMBSP08397 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMBSP08397 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMBSP08397 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HMBSP08397 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMBSP08397 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMBSP08397 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMBSP08397 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMBSP08397 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMBSP08397 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMBSP08397 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMBSP08397 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMBSP08397 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMBSP08397 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMBSP08397 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMBSP08397 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMBSP08397 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMBSP08397 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMBSP08397 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMBSP08397 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMBSP08397 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMBSP08397 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMBSP08397 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMBSP08397 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMBSP08397 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMBSP08397 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMBSP08397 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMBSP08397 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMBSP08397 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMBSP08397 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMBSP08397 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMBSP08397 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMBSP08397 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMBSP08397 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HMBSP08397 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMBSP08397 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMBSP08397 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMBSP08397 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMBSP08397 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMBSP08397 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMBSP08397 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMBSP08397 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMBSP08397 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMBSP08397 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMBSP08397 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMBSP08397 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMBSP08397 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMBSP08397 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMBSP08397 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMBSP08397 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HMBSP08397 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMBSP08397 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMBSP08397 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMBSP08397 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMBSP08397 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMBSP08397 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMBSP08397 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMBSP08397 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMBSP08397 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMBSP08397 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMBSP08397 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMBSP08397 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMBSP08397 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMBSP08397 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMBSP08397 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMBSP08397 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMBSP08397 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMBSP08397 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMBSP08397 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMBSP08397 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMBSP08397 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMBSP08397 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMBSP08397 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms