Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNC2P02585 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNC2P02585 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNC2P02585 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNC2P02585 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms