Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LGR5O75473 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LGR5O75473 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LGR5O75473 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LGR5O75473 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LGR5O75473 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LGR5O75473 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LGR5O75473 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LGR5O75473 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGR5O75473 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGR5O75473 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGR5O75473 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGR5O75473 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGR5O75473 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGR5O75473 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGR5O75473 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGR5O75473 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGR5O75473 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGR5O75473 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LGR5O75473 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LGR5O75473 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LGR5O75473 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LGR5O75473 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LGR5O75473 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LGR5O75473 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LGR5O75473 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LGR5O75473 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LGR5O75473 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGR5O75473 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGR5O75473 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGR5O75473 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGR5O75473 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LGR5O75473 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LGR5O75473 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR5O75473 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR5O75473 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR5O75473 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR5O75473 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LGR5O75473 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGR5O75473 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGR5O75473 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LGR5O75473 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LGR5O75473 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR5O75473 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR5O75473 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR5O75473 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR5O75473 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR5O75473 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LGR5O75473 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LGR5O75473 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LGR5O75473 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LGR5O75473 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR5O75473 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR5O75473 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR5O75473 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR5O75473 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR5O75473 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR5O75473 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR5O75473 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR5O75473 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR5O75473 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR5O75473 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR5O75473 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LGR5O75473 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGR5O75473 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGR5O75473 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGR5O75473 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGR5O75473 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGR5O75473 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LGR5O75473 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR5O75473 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR5O75473 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR5O75473 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
LGR5O75473 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGR5O75473 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LGR5O75473 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LGR5O75473 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LGR5O75473 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LGR5O75473 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LGR5O75473 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LGR5O75473 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LGR5O75473 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LGR5O75473 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LGR5O75473 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LGR5O75473 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LGR5O75473 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LGR5O75473 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGR5O75473 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGR5O75473 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGR5O75473 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGR5O75473 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGR5O75473 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGR5O75473 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LGR5O75473 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGR5O75473 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LGR5O75473 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LGR5O75473 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LGR5O75473 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LGR5O75473 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LGR5O75473 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1860.4 ms