Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SPAG9O60271 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SPAG9O60271 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
SPAG9O60271 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SPAG9O60271 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SPAG9O60271 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms