Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX16O60231 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX16O60231 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DHX16O60231 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DHX16O60231 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DHX16O60231 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DHX16O60231 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DHX16O60231 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DHX16O60231 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DHX16O60231 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DHX16O60231 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DHX16O60231 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DHX16O60231 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DHX16O60231 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DHX16O60231 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DHX16O60231 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DHX16O60231 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DHX16O60231 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DHX16O60231 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DHX16O60231 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DHX16O60231 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DHX16O60231 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DHX16O60231 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DHX16O60231 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DHX16O60231 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DHX16O60231 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DHX16O60231 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DHX16O60231 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DHX16O60231 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX16O60231 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX16O60231 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX16O60231 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX16O60231 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX16O60231 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX16O60231 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX16O60231 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX16O60231 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX16O60231 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX16O60231 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DHX16O60231 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DHX16O60231 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DHX16O60231 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DHX16O60231 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DHX16O60231 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DHX16O60231 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DHX16O60231 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX16O60231 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX16O60231 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX16O60231 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX16O60231 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX16O60231 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX16O60231 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX16O60231 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX16O60231 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DHX16O60231 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DHX16O60231 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DHX16O60231 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DHX16O60231 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DHX16O60231 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DHX16O60231 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DHX16O60231 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DHX16O60231 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DHX16O60231 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DHX16O60231 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DHX16O60231 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DHX16O60231 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DHX16O60231 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DHX16O60231 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DHX16O60231 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX16O60231 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX16O60231 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX16O60231 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX16O60231 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX16O60231 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX16O60231 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX16O60231 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX16O60231 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX16O60231 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX16O60231 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX16O60231 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DHX16O60231 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DHX16O60231 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DHX16O60231 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DHX16O60231 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
DHX16O60231 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DHX16O60231 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DHX16O60231 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DHX16O60231 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DHX16O60231 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DHX16O60231 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DHX16O60231 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DHX16O60231 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DHX16O60231 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DHX16O60231 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DHX16O60231 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DHX16O60231 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DHX16O60231 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DHX16O60231 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DHX16O60231 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DHX16O60231 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms