Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCO2O43819 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCO2O43819 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCO2O43819 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCO2O43819 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCO2O43819 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCO2O43819 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCO2O43819 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCO2O43819 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCO2O43819 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCO2O43819 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCO2O43819 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCO2O43819 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCO2O43819 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCO2O43819 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCO2O43819 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCO2O43819 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCO2O43819 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCO2O43819 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCO2O43819 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCO2O43819 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCO2O43819 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCO2O43819 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCO2O43819 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCO2O43819 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCO2O43819 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCO2O43819 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCO2O43819 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCO2O43819 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCO2O43819 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCO2O43819 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCO2O43819 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCO2O43819 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCO2O43819 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCO2O43819 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCO2O43819 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCO2O43819 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCO2O43819 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCO2O43819 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCO2O43819 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCO2O43819 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCO2O43819 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SCO2O43819 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCO2O43819 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCO2O43819 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCO2O43819 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCO2O43819 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCO2O43819 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCO2O43819 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SCO2O43819 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCO2O43819 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCO2O43819 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCO2O43819 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCO2O43819 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCO2O43819 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCO2O43819 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCO2O43819 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SCO2O43819 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCO2O43819 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCO2O43819 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCO2O43819 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCO2O43819 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCO2O43819 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCO2O43819 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCO2O43819 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SCO2O43819 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCO2O43819 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCO2O43819 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCO2O43819 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCO2O43819 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SCO2O43819 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCO2O43819 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SCO2O43819 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCO2O43819 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCO2O43819 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCO2O43819 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCO2O43819 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCO2O43819 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SCO2O43819 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCO2O43819 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCO2O43819 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCO2O43819 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCO2O43819 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCO2O43819 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCO2O43819 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCO2O43819 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCO2O43819 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCO2O43819 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SCO2O43819 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCO2O43819 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SCO2O43819 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCO2O43819 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCO2O43819 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCO2O43819 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCO2O43819 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCO2O43819 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCO2O43819 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SCO2O43819 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SCO2O43819 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SCO2O43819 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms