Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP8B1O43520 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP8B1O43520 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP8B1O43520 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms