Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTRA2O43464 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTRA2O43464 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms