Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC01565O15544 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC01565O15544 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01565O15544 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms