Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
J3KRW8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
J3KRW8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
J3KRW8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
J3KRW8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
J3KRW8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
J3KRW8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
J3KRW8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
J3KRW8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3KRW8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3KRW8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3KRW8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
J3KRW8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
J3KRW8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3KRW8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3KRW8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
J3KRW8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
J3KRW8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3KRW8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3KRW8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3KRW8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3KRW8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3KRW8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3KRW8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3KRW8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3KRW8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3KRW8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3KRW8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
J3KRW8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
J3KRW8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
J3KRW8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
J3KRW8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
J3KRW8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
J3KRW8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
J3KRW8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
J3KRW8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3KRW8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3KRW8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3KRW8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3KRW8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
J3KRW8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3KRW8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
J3KRW8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3KRW8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3KRW8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3KRW8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3KRW8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3KRW8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3KRW8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3KRW8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
J3KRW8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
J3KRW8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3KRW8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3KRW8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3KRW8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3KRW8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3KRW8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3KRW8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3KRW8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3KRW8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3KRW8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3KRW8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3KRW8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
J3KRW8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
J3KRW8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
J3KRW8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
J3KRW8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
J3KRW8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
J3KRW8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
J3KRW8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
J3KRW8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
J3KRW8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
J3KRW8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
J3KRW8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
J3KRW8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3KRW8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3KRW8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3KRW8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3KRW8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3KRW8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3KRW8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3KRW8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3KRW8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3KRW8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3KRW8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3KRW8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3KRW8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3KRW8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
J3KRW8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3KRW8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3KRW8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
J3KRW8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3KRW8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3KRW8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3KRW8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3KRW8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3KRW8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3KRW8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3KRW8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
J3KRW8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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