Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BNX3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BNX3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
H3BNX3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BNX3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BNX3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BNX3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BNX3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BNX3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BNX3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BNX3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
H3BNX3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BNX3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BNX3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BNX3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BNX3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BNX3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
H3BNX3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BNX3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BNX3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BNX3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
H3BNX3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BNX3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BNX3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BNX3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BNX3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BNX3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BNX3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
H3BNX3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BNX3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BNX3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BNX3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BNX3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BNX3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BNX3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BNX3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
H3BNX3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BNX3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BNX3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BNX3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BNX3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
H3BNX3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BNX3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BNX3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
H3BNX3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BNX3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BNX3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BNX3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BNX3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
H3BNX3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BNX3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BNX3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BNX3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BNX3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BNX3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BNX3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BNX3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BNX3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BNX3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
H3BNX3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BNX3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BNX3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
H3BNX3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BNX3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BNX3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BNX3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BNX3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BNX3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BNX3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BNX3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BNX3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BNX3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BNX3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
H3BNX3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BNX3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BNX3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BNX3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BNX3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
H3BNX3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BNX3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BNX3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BNX3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BNX3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BNX3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BNX3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BNX3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BNX3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BNX3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BNX3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BNX3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BNX3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BNX3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BNX3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
H3BNX3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BNX3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BNX3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BNX3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BNX3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BNX3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
H3BNX3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms