Protein–RNA interactions for Protein: A8MYZ0

MINDY4B, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4B, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY4BA8MYZ0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MINDY4BA8MYZ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MINDY4BA8MYZ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MINDY4BA8MYZ0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
MINDY4BA8MYZ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MINDY4BA8MYZ0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms