Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GABRR3A8MPY1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GABRR3A8MPY1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GABRR3A8MPY1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms