Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMIM23A6NLE4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SMIM23A6NLE4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM23A6NLE4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms