Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC01549A6NIU2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC01549A6NIU2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC01549A6NIU2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms