Protein–RNA interactions for Protein: A6NHJ4

ZNF860, Zinc finger protein 860, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF860A6NHJ4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF860A6NHJ4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF860A6NHJ4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF860A6NHJ4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms