Protein–RNA interactions for Protein: A5YM72

CARNS1, Carnosine synthase 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARNS1A5YM72 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARNS1A5YM72 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CARNS1A5YM72 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CARNS1A5YM72 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
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