Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSC5DA1L4H1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SSC5DA1L4H1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SSC5DA1L4H1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms