Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SYCE3A1L190 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SYCE3A1L190 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYCE3A1L190 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYCE3A1L190 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms