Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMEM223A0PJW6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM223A0PJW6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms