Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRBV5-3A0A0A0MS03 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRBV5-3A0A0A0MS03 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRBV5-3A0A0A0MS03 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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