Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NUDCQ9Y266 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NUDCQ9Y266 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NUDCQ9Y266 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NUDCQ9Y266 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms