Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT8

ZC3H4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H4Q9UPT8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZC3H4Q9UPT8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZC3H4Q9UPT8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZC3H4Q9UPT8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZC3H4Q9UPT8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZC3H4Q9UPT8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZC3H4Q9UPT8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZC3H4Q9UPT8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZC3H4Q9UPT8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ZC3H4Q9UPT8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ZC3H4Q9UPT8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZC3H4Q9UPT8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZC3H4Q9UPT8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.9 ms