Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF3C4Q9UKN8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF3C4Q9UKN8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF3C4Q9UKN8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C4Q9UKN8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms