Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNNA3Q9UI47 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTNNA3Q9UI47 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CTNNA3Q9UI47 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTNNA3Q9UI47 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms