Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DKK2Q9UBU2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DKK2Q9UBU2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DKK2Q9UBU2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms