Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCOR3Q9P2K3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RCOR3Q9P2K3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RCOR3Q9P2K3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms