Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GPHNQ9NQX3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPHNQ9NQX3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPHNQ9NQX3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms