Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTN4Q9NQC3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
RTN4Q9NQC3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RTN4Q9NQC3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RTN4Q9NQC3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms