Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCK1

ZDBF2, DBF4-type zinc finger-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDBF2Q9HCK1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZDBF2Q9HCK1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZDBF2Q9HCK1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZDBF2Q9HCK1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDBF2Q9HCK1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDBF2Q9HCK1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZDBF2Q9HCK1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDBF2Q9HCK1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDBF2Q9HCK1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDBF2Q9HCK1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDBF2Q9HCK1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDBF2Q9HCK1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDBF2Q9HCK1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDBF2Q9HCK1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZDBF2Q9HCK1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDBF2Q9HCK1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDBF2Q9HCK1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZDBF2Q9HCK1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms